1972 Münih Olimpiyatları'nda Filistin'in Kurtuluşu için mücadele eden 'Kara Eylül' adlı örgüt İsrailli sporcu kafilesini rehin alır. Uzun pazarlıklarının ardından rehinelerle birlikte havaalanına doğru yola çıkarlar; ancak burada Alman polisinin müdahalesi sonucu beklenmedik bir trajedi yaşanır ve tüm sporcular öldürülür. İsrail hükümeti acil olarak toplanarak bu olay karşısında nasıl tepki verileceğini tartışır ve misilleme yapmaya karar verir. Böylece İsrail İstihbarat Teşkilatı Mossad, 'Tanrının Gazabı' adını verdikleri hukuk dışı bir opersyon başlatır. Vatansever bir istihbarat subayı olan Avner (Eric Bana), beş kişilik bir ekiple operasyonun Avrupa ayağının liderliğini üstlenir. Amaç 'Kara Eylül' örgütünün hem eylem alanında hem de düşünsel örgütlenme alanında etkin olan isimlerini suikastlerle ortada kaldırmak ve örgüte göz dağı vermektir. Ancak işler beklendiği gibi gelişmez.