Yeryüzünün en ıssız ve acımasız bölgesi Antartika'nın kalbinde yaşanan İmparator Penguenler'in öyküsünü anlatan "İmparator'un Yolculuğu", penguenlerin üremek için her yıl çıkmak zorunda kaldıkları zorlu yolculuğu perdeye taşıyor. Bir erkek, bir kadın ve bir çocuk oyuncunun seslendirdiği penguenler, okyanusun içinde adlarıına yakışır bir yaşama sahipken, üreme mevsiminde karaya çıktıkları zaman zorluklarla karşı karşıya kalıyor ve beceriksizce yürüyen koca bir kuş oluveriyorlar. Bu asil penguen türünün büyük bir ustalıkla hareket edebildiği buzlu suları, açlık ve sefalet pahasına terk etmesinin ise tek bir nedeni var: Tüm canlıların en büyük amacı, yani, kendi türünün devamı...