Başkalarının gözünde idealist ve ilkeli bir yönetmen olan Ahmet, Dostoyevski'nin Suç ve Ceza romanını filme çekmek istemekte, ancak bunun için pek de hevesli görünmemektedir. Aslında onun hevessizliği sadece film çekme konusunda değil, hayatın her alanında takındığı genel tavır gibidir; yaşadığı hayata karşı nedensiz bir kayıtsızlık içindedir. Kendini evine kapatmış, kendi küçük dünyasında adeta bir yabancı gibi yaşamaktadır. Birlikte yaşadığı sevgilisi Serap günden güne daha da katlanılmaz bir hal alan bu ruh halini, Ahmet'in hayatında başka bir kadın olduğuna yorar. İyice bunaltıcı hale gelen kıskançlık krizleri ve sorgulamaların birinde Ahmet, sıkılıp, hayatında başka biri olduğu yalanını söyler ve Serap evi terk eder. Bir süre sonra, arkadaşları Serap'ın intihar girişiminde bulunduğunu söylemek için Ahmet'i ararlar, ancak o kayıtsızlığını korur. Bütün bunlar olurken asistanı Elif, Ahmet gibi işleri oluruna bırakmamıştır ve filmin hazırlık çalışmalarını sürdürmekte, romanın kahramanı Roskolnikof'u oynayacak kişiyi aramaktadır. Fakat Ahmet, Elif'in deneme çekimlerine katılanların hiçbirini beğenmez. Sonunda bir süre önce evine hırsızlık amacıyla girerken yakaladığı ancak polise teslim etmeden bıraktığı genç hırsızı oynatmaya karar verir ve hırsızı aramaya başlar. Bu esnada, Serap'ın hayatından çıkmasıyla asistanı Elif, zaten büyük etkisi altında olduğu Ahmet'e daha da yakınlaşır ve onun evine taşınır.
Zeki Demirkubuz'un 'Karanlık Üzerine Öyküler' başlığında çektiği "Yazgı" ve "İtiraf" filmlerinin uzantısı olarak görülebilecek "Bekleme Odası", hayatı hep ölümü bekler gibi bir hisle yaşayan bir yönetmenin dünyası üzerinden insan doğasını sorgulayan, Demirkubuz'un önceki filmleri karanlık ve klostrofobik bir film.