Eylül Fırtınası Metin adındaki bir çocuğun (Kutay Özcan) gözünden 12 Eylül döneminin hikayesini anlatıyor. Metin'in açısından 12 Eylül'ün sosyal yaşamda nasıl değişikliklere yol açtığı, anne ve babasıyla ilişkilerindeki farklılıkları, ailenin ister istemez parçalanışını, onurlu ve grurlu bir "Efe" olan dedenin (Tarık Akan) yaşadıkları karşısında giderek akli dengesini yitirişini izliyoruz. Bütün bu trajik durumlar Metin'in naif dünyası, çocukca değerlendirmeleri ve biraz da muzır zekası nedeniyle zaman zaman komik bir hal alıyor.